DMSO como modulador transcricional em células do ligamento periodontal de humanos durante a osteogênese
Documento
Informações
Título
DMSO como modulador transcricional em células do ligamento periodontal de humanos durante a osteogênese
Autor(es)
Beatriz Ganhito Françoso
Orientador(es)
Prof.ª Dr.ª Denise Carleto Andia
Data de Defesa
03/03/2021
Resumo (EN)
The understanding of molecular mechanisms involved in bone tissue formation is crucial for the success of tissue regeneration therapies, driving the development of new medical approaches. Researches have demonstrated periodontal ligament cells (PDLCs) are promising candidates in tissue repair; however, the mechanisms underlying their heterogenous commitment to osteogenesis might have impact on clinical results. Dimethylsulfoxide (DMSO) can diffuses through biological membranes; although the literature brings some information about its osteogenic properties, the mechanisms and signaling pathways are not yet characterize. Here, we investigated the regulatory mechanisms related to the low osteogenic potential of PDLCs (lPDLCs), aiming to define genes and signaling pathways that could be modulated by DMSO to increase the osteogenic potential. l-PDLCs were characterized regarding their osteogenic potential (Alizarin Red, AR), cell surface markers (Flow cytometry) and population doubling time (PDT). After plating and cellular adhesion in standard culture medium, l-PDLCs were pre-treated with DMSO (0.025 %) (OM_DMSO_low) for 72 h and submitted to osteogenic induction in vitro, or, after 72 h, cells were submitted to osteogenic induction in vitro (OM_low), for 10 and 21 days. After 21 days, the AR staining was performed. After 10 days, the RNA from 3 independent experiments were extracted, the sequencing was performed and the Bioinformatic analysis were conducted accordingly. The l-PDLCs were classified as such, after comparison with another PDLCs, which have demonstrated increased capacity to mineral nodules formation in vitro (p ≤ 0.01). The cell phenotyping showed the presence of surface markers CD105 and CD166 and the absence of CDC34 and CD45, a characteristic scenario of mesenchymal cells; the PDT assay indicated 29,78 h for cellular duplication. At 21 days, the AR demonstrated an increase in the mineral nodules’ formation in vitro, in the OM_DMSO_low group (p ≤ 0.01 x OM_low). The transcriptome analysis revealed 824 differentially expressed genes (DGEs) in the OM_DMSO_low and 963 in the OM_low, with 46 DGEs in common, according to log2FoldChange 1.5. Some main genes related to classical signaling pathways associated to osteogenesis, such as ALPL, BGLAP, COL1A1 and SP7, were found to be more expressed in the OM_DMSO_low (log2FoldChange). The enrichment gene score analysis highlighted DMSO as capable of modulating some signaling pathways related to osteogenesis, such as Hedgehog (Hh) and Notch. In the Hallmarks, KEGG and WikiPathways analysis, the Hh cell ligands (DHH, IHH and SHH), the membrane receptor (PTCH1) and the transcriptor factors (TFs) GLI1, GLI2 and GLI3 were more enriched, while the negative regulator RAB23 was less enriched in OM/DMSO_low, according to NOM p value ≤ 0,05 and FDR q ≤ 0,25 value analysis. Yet, according to these same analysis parameters, the Notch signaling pathway receptors (NOTCH1, NOTCH2 e NOTCH3), the cell ligands JAG1 e DLL3 and the TF HES1 were also enriched in OM_DMSO_low. DMSO can modulate signaling pathways and genes related to osteogenesis, increasing the in vitro osteogenic potential of PDLCs presenting low osteogenic potential.
Resumo
Introdução: Compreender mecanismos moleculares na formação do tecido ósseo é fundamental para o sucesso das terapias de regeneração tecidual, impulsionando o desenvolvimento de novas abordagens médicas. Pesquisas têm demonstrado o potencial de células mesenquimais do ligamento periodontal humano (PDLCs) na reparação tecidual; porém, sua heterogeneidade no potencial osteogênico pode impactar nos resultados clínicos esperados. Dimetilsulfóxido (DMSO) difunde-se pelas membranas biológicas e, embora a literatura forneça informações sobre sua ação como agente osteoindutor, mecanismos e vias não foram totalmente caracterizados. Objetivo: Nesse sentido, o objetivo foi investigar mecanismos regulatórios associados ao baixo potencial osteogênico de PDLCs (l-PDLCs) e definir se genes e vias de sinalização relacionadas à osteogênese podem ser ativadas pelo DMSO. Método: Inicialmente, as l-PDLCs foram caracterizadas quanto ao tempo de duplicação celular (PDT), multipotencialidade (citometria de fluxo) e potencial osteogênico (Alizarin Red - AR). Após plaqueamento e adesão celular, as l-PDLCs ou foram induzidas à diferenciação osteogênica somente (OM_low) ou foram pré-tratadas com DMSO 0.025 % por 72 h (OM_DMSO_low) e então induzidas à diferenciação osteogênica. Após 21 dias, foi realizada a coloração com AR. Após 10 dias, foi extraído RNA de 3 experimentos independentes, o sequenciamento foi realizado e as análises de Bioinformática foram conduzidas. Para ser classificada como l-PDLCs, esta população celular foi comparada a outra PDLCs, que demonstrou maior potencial para deposição de nódulos minerais in vitro (p ≤ 0.01). Resultados: A fenotipagem mostrou a presença dos marcadores de superfície celular CD105 e CD166 e ausência de CD34 e CD45, indicando presença de células mesenquimais indiferenciadas; o PDT foi avaliado em 29,78 h. AR aos 21 dias demonstrou aumento de nódulos minerais in vitro, no grupo OM_DMSO_low (p ≤ 0.01 x OM_low). O transcriptoma revelou que, dos genes que apresentaram log2FoldChange 1.5 (genes diferencialmente expressos - DGEs), 824 eram do grupo OM_DMSO_low e 963 no grupo OM_low, sendo 46 DGEs em comum. Com relação a genes que participam de vias de sinalização envolvidas na diferenciação osteogênica, ALPL, BGLAP, COL1A1 e SP7 foram mais expressos em OM_DMSO_low (log2FoldChange). As análises de enriquecimento gênico destacaram o DMSO como modulador de várias vias de sinalização associadas à osteogênese, como Hedgehog (Hh) e Notch. Nas análises Hallmarks, KEGG e WikiPathways, os ligantes da via Hh (DHH, IHH e SHH), os receptores de membrana (PTCH1 e SMO) e os fatores de transcrição (FTs) GLI1, GLI2 e GLI3 foram mais enriquecidos, enquanto que o regulador negativo da via, o RAB23, foi menos enriquecido em OM_DMSO_low, de acordo com o NOM p value ≤ 0,05 e FDR q value ≤ 0,25. De acordo com esses mesmos parâmetros, os receptores da via Notch (NOTCH1, NOTCH2 e NOTCH3), os ligantes JAG1 e DLL3 e o FT HES1 também foram mais enriquecidos em OM_DMSO_low. O DMSO modula vias de sinalização e genes ligados à osteogênese, o que pode estar relacionado ao aumento do potencial osteogênico de PDLCs com baixo potencial osteogênico observado in vitro.
O presente trabalho foi realizado com apoio da Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Brasil (CAPES) - Código de Financiamento 001.
Tipo
Dissertação
Palavras-chave
ranscriptoma. RNA-Seq. Célula. Periodontal. Osteogênese. Vias de Sinalização. Genes
Área de Concentração
Clínica Odontológica
Linha de Pesquisa
Estudos dos mecanismos relacionados à ocorrência das condições do sistema estomatognático
Instituição
UNIP
Direito de Acesso
Acesso Aberto