A Universidade Paulista possui Programas de Mestrado e Doutorado recomendados pela CAPES nas áreas da saúde, das ciencias exatas e humanas. Esses Programas objetivam o desenvolvimento de estudos aplicados, a realizaçao de pesquisas e a produçao de conhecimentos que concorram para o avanço científico e para a melhoria da qualidade de vida no País e no mundo.